以下各项支出中，可以在计算企业所得税应纳税所得额时扣除的是（）

A.企业为员工缴纳的商业保险费

B.企业因为延迟支付货款而支付的违约金(正确答案)

C.以现金方式支付给某中介公司的佣金

D.赴灾区慰问时直接向灾民发放的慰问金

答案解析：

选项A，企业为股东和职工缴纳的商业保险费不允许扣除。选项B：企业支付给平等主体的各项与经营活动有关的罚款、违约金等，可以扣除。选项C：除委托个人代理外，企业以现金等非转账方式支付的手续费及佣金不得在所得税前扣除；选项D：企业发生的直接发给灾民的慰问金，不可以扣除；捐赠支出只有通过公益性社会团体或者县级（含县级）以上人民政府及其部门发生的公益性捐赠支出，不超过年度利润总额12%的部分，准予扣除，超过部分结转未来三年税前扣除。