中国特色社会主义制度是中国特色社会主义法治体系的根本制度基础，是全面推进依法治国的根本（）。

A.政治保障

B.制度保障

正确答案：B

这是一道填空题，考察的是中国特色社会主义制度与全面推进依法治国之间的关系。首先，我们要理解题目中的关键信息：中国特色社会主义制度是法治体系的根本制度基础，我们需要确定这一制度在全面推进依法治国中起到的根本性作用。

接下来，分析两个选项：

A. 政治保障

政治保障通常指的是政治环境、政治制度或政治决策对某一进程或目标的支持和保护。然而，在此语境下，我们讨论的是中国特色社会主义制度作为法治体系的“根本制度基础”，更侧重于制度层面的支撑，而非单纯的政治环境或决策。

B. 制度保障

制度保障指的是通过一系列制度、规定和政策来确保某一进程或目标的稳定实施。这与题目中提到的“根本制度基础”相呼应，强调了中国特色社会主义制度在全面推进依法治国中提供的结构性、系统性的支持。

综合考虑，中国特色社会主义制度作为法治体系的根本制度基础，它为全面推进依法治国提供了全面、稳定、系统的制度环境，确保法治建设的顺利进行。因此，这一制度在全面推进依法治国中起到的根本性作用，更准确地说是“制度保障”。

所以，正确答案是B：制度保障。